El Rector es la máxima autoridad en el ámbito directivo y académico de la Institución Educativa.
Las funciones del Rector del Instituto Parroquial Jesús de la Buena Esperanza, son:

Actualmente la Rectoría del Instituto Parroquial Jesús de la Buena Esperanza, está bajo la dirección de Pbro. Mg. José Fernando Marín Flórez, Sacerdote de la Arquidiócesis de Medellín, Licenciado en Educación Primaria de la Universidad de Antioquia, Bachiller Canónico en Filosofía de la Universidad Pontificia Bolivariana, Bachiller en Sagrada Teología de la Universidad Pontificia Bolivariana , Teólogo de la de la Universidad Pontificia Bolivariana , Especialista en Gerencia Educativa de la Universidad Católica de Manizales, Especialista en Cultura y Clima Organizacional de la Institución Universitaria Salazar y Herrera, Magíster en Educación de la Universidad de Medellín.